小鼠細(xì)胞系STR數(shù)據(jù)是指通過短串聯(lián)重復(fù)序列(STR)基因位點分析獲得的特定于小鼠細(xì)胞系的遺傳信息。這些數(shù)據(jù)通常包括在小鼠基因組中特定位置的STR序列重復(fù)次數(shù),用作細(xì)胞系的身份標(biāo)記。
一、STR數(shù)據(jù)更新的重要價值
1、精準(zhǔn)鑒定細(xì)胞身份?
更新的STR數(shù)據(jù)庫提供更全面的位點信息(如Cellosaurus數(shù)據(jù)庫從8個位點擴展至18個位點),通過比對樣本與數(shù)據(jù)庫的STR圖譜匹配度(≥80%判定同源),可明確識別細(xì)胞系真實性?。例?:2025年Cellosaurus 52.0版新增13株小鼠細(xì)胞STR數(shù)據(jù),覆蓋更多近交系品系,避免因遺傳相似性導(dǎo)致的誤判。?
2、解決交叉污染歷史難題?
據(jù)統(tǒng)計,約24%細(xì)胞系存在交叉污染(如HeLa污染事件)?。STR更新后:新增細(xì)胞系(如CT26.WT結(jié)腸癌細(xì)胞)的STR圖譜可快速識別實驗室污染;多等位基因位點預(yù)警機制可自動標(biāo)記可疑樣本?。?
3、?跨物種污染檢測能力提升?
現(xiàn)代小鼠STR試劑盒整合人源基因座(如TH01),一次檢測既可鑒定小鼠細(xì)胞身份,又可同步篩查人源細(xì)胞污染。
小鼠細(xì)胞系STR數(shù)據(jù)的更新確實有助于減少交叉污染,原因如下:
1、增強數(shù)據(jù)庫的全面性:每次更新都增加了新的STR數(shù)據(jù),覆蓋了更多小鼠細(xì)胞系,這意味著研究人員在進(jìn)行細(xì)胞系鑒定時,有更廣泛的參照數(shù)據(jù),提高了鑒定的全面性和可靠性。
2、促進(jìn)科學(xué)透明度和可重復(fù)性:更新的STR數(shù)據(jù)允許科研人員在投稿時提供更詳細(xì)的細(xì)胞系鑒定報告,這有助于提高研究的透明度和可重復(fù)性。SCI期刊對細(xì)胞鑒定報告的要求逐年增加,STR數(shù)據(jù)的更新使得這一要求更加容易滿足。
3、輔助識別交叉污染:STR分型圖譜中,如果多個STR位點同時出現(xiàn)多等位基因,可能表明存在交叉污染。更新的STR數(shù)據(jù)庫幫助科研人員在比對數(shù)據(jù)時,更快速地識別出交叉污染的情況。
4、提高身份確認(rèn)準(zhǔn)確性:隨著STR數(shù)據(jù)的不斷更新,更多的小鼠細(xì)胞系被收錄進(jìn)數(shù)據(jù)庫,這使得研究人員能夠更準(zhǔn)確地通過STR分型確認(rèn)細(xì)胞系的身份。STR分型技術(shù)基于細(xì)胞的DNA指紋,可以高度特異地識別不同細(xì)胞系,從而減少因錯誤標(biāo)記或交叉污染導(dǎo)致的實驗結(jié)果偏差。
5、指導(dǎo)實驗設(shè)計和操作:了解最新的STR數(shù)據(jù)更新,科研人員可以更好地設(shè)計實驗,避免使用可能交叉污染的細(xì)胞系,并在操作過程中采取預(yù)防措施,減少交叉污染的風(fēng)險。
STR數(shù)據(jù)更新通過?擴大數(shù)據(jù)庫規(guī)模?、?優(yōu)化位點設(shè)計?、?整合跨物種檢測?三重機制,顯著提升小鼠細(xì)胞交叉污染防控能力。但需注意:?定期驗證?(每2個月)和?結(jié)合形態(tài)學(xué)復(fù)核?仍是必要補充手段。隨著期刊強制要求(如Nature)和NIST標(biāo)準(zhǔn)推廣?,持續(xù)更新的STR數(shù)據(jù)庫將成為細(xì)胞實驗質(zhì)控的核心工具。